Zastávka Hostivař je součástí modernizace pražského železničního uzlu, který propojuje hlavní nádraží přes České Budějovice do Rakouska. Současná zastávka bude sloužit k jinému účelu.

Rozpočet na stavbu je téměř 979 milionů korun, za které vznikne nová výpravní budova a dvě ostrůvková nástupiště v kolejišti. Pro stavbu se počítá s využitím evropských dotací z Operačního programu Doprava.

V následujícím projektu bude modernizováno spojení ve směru na hlavní nádraží k vinohradskému tunelu, kde se počítá se zrušením málo využívané zastávky Strašnice a se zřízením zastávek Eden a Zahradní Město.